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Title: Interação de péptidos inibidores de fusão do HIV com modelos de membranas biológicas: um estudo por dinâmica molecular
Authors: Pronto, Catarina Sofia Martins
Advisors: Canto, António Manuel Teixeira Martins do
Keywords: HIV
SIDA
Péptidos inibidores de fusão do HIV
Bicamada lipídica
C34
SC22EK
SC29EK
SC34
SC34EK
SC5EK
Interação péptido-membranas
Dinâmica molecular
Issue Date: 18-Dec-2019
Publisher: Universidade de Évora
Abstract: O HIV interage com as células-alvo pela ação das glicoproteínas virais gp41 e gp120. Estas proteínas são reconhecidas pelos co-receptores CCR5 e CXCR4, considerados como os principais recetores responsáveis pela entrada do vírus nas células alvo. O desenvolvimento de novas terapias e medicamentos para o tratamento da infeção do HIV é um processo contínuo. A forma como certos péptidos inibidores de fusão interagem com as membranas em solução e a manutenção de estruturas helicoidais estáveis têm sido correlacionadas com o aumento da capacidade inibitória do HIV para com as células alvo. Desta forma, no desenvolvimento deste trabalho, com base nos resultados obtidos de Veiga e os seus colaboradores [Veiga et al., 2004], observou-se por dinâmica molecular (MD) a interação de seis péptidos inibidores de fusão (C34, SC22EK, SC29EK, SC34, SC34EK e SC35EK) do HIV com modelos de membranas de POPC e POPC:Chol (1:1). Os resultados aqui apresentados mostram que, uma vez os péptidos adsorvidos, as bicamadas apresentam diferentes comportamentos e sofrem modificações na sua estrutura e difusão, assim como os próprios péptidos. De todos os péptidos simulados o que apresentou uma maior eficácia e, consequentemente, uma maior helicicidade foi o péptido SC34EK. Por outro lado, o péptido SC22EK foi o péptido que demonstrou menor capacidade de interagir com as membranas; Interaction of HIV fusion inhibitor peptides with biological membrane models: a molecular dynamics study Abstract: HIV interacts with target cells by the action of gp41 and gp120 viral glycoproteins. These proteins are recognized by the CCR5 and CXCR4 co-receptors, which are considered to be the main receptors responsible for virus entry into target cells. The development of new therapies and medicines to treat HIV infection is an ongoing process. How certain fusion inhibitor peptides interact with membranes in solution and the maintenance of stable helical structures has been correlated with increased inhibitory capacity of HIV to target cells. Thus, in the development of this work, based on the results obtained from Veiga and his collaborators [Veiga et al., 2004], molecular interaction (MD) observed the interaction of six fusion inhibitor peptides (C34, SC22EK, SC29EK, SC34, SC34EK and SC35EK) with membrane models of POPC and POPC: Chol (1: 1). The results presented here show that, once the adsorbed peptides, the bilayers exhibit different behaviors and undergo modifications in their structure and diffusion, as do the peptides themselves. Of all the simulated peptides that showed the highest efficacy and, consequently, the greatest helicicity was the SC34EK peptide. On the other hand, SC22EK peptide was the peptide that showed the least ability to interact with membranes.
URI: http://hdl.handle.net/10174/26373
Type: masterThesis
Appears in Collections:BIB - Formação Avançada - Teses de Mestrado

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