http://hdl.handle.net/10174/7056 Mon, 05 Oct 2026 10:16:43 GMT 2026-10-05T10:16:43Z http://hdl.handle.net/10174/42641 Title: New Insights into Somatic Embryogenesis Efficiency in Olea europaea L Authors: Pires, Rita Nobre Abstract: Novos contributos para o estudo da eficiência da embriogénese somática em Olea europaea L. - Resumo: embriogénese somática (ES) apresenta-se como uma estratégia alternativa para a propagação clonal de oliveira, com particular interesse em genótipos caracterizados por elevada recalcitrância ao desenvolvimento de raízes adventícias quando propagados pelos métodos convencionais. No entanto, a elevada recalcitrância dos tecidos adultos à indução de estruturas embriogénicas continua a restringir a aplicação desta tecnologia. Assim, o estudo dos mecanismos moleculares associados à resposta embriogénica assume particular relevância para o desenvolvimento de sistemas de propagação alternativos aplicáveis à olivicultura nacional. A ES constitui uma resposta morfogénica induzida por estímulos exógenos que envolve uma reprogramação celular ao nível molecular, refletida em alterações bioquímicas e fisiológicas que culminam na diferenciação de estruturas embriogénicas. Neste processo, a interação entre os explantes e o meio de cultura é determinante, incluindo o contacto com biomoléculas secretadas pelo material vegetal. Este intercâmbio de moléculas, nomeadamente proteínas e metabolitos, entre os espaços intra e extracelulares poderá participar na modulação da resposta embriogénica. O presente estudo teve como objetivo identificar mecanismos envolvidos na eficiência da ES em oliveira através da caracterização do proteoma de linhas embriogénicas de alta (HE) e baixa (LE) eficiência e correspondente secretoma, por LC-MS/MS, complementada pela análise do exometaboloma por 1H RMN. A capacidade das biomoléculas secretadas para induzir a resposta embriogénica foi avaliada através da aplicação de meio de cultura (CM) de linhas HE a linhas LE e material adulto. Os resultados revelaram uma maior abundância de proteínas associadas ao transporte vesicular, sinalização e reorganização celular em linhas HE, que apresentaram, no perfil extracelular, proteínas relacionadas com a regulação redox e a dinâmica da parede celular, bem como uma utilização mais eficiente do carbono. A aplicação do CM permitiu validar o papel das moléculas secretadas na resposta embriogénica ao promover um aumento da proliferação celular e a formação de estruturas embriogénicas em material recalcitrante; Somatic embryogenesis (SE) has emerged as an alternative strategy for the clonal propagation of olive trees, particularly for genotypes characterised by high recalcitrance to adventitious root development when propagated using conventional methods. However, the high recalcitrance of adult tissues to the induction of embryogenic structures continues to limit the application of this technology. Therefore, understanding the molecular mechanisms associated with the embryogenic response is of particular importance for the development of alternative propagation systems applicable to the national olive industry. SE is a morphogenic response induced by exogenous stimuli that involves cellular reprogramming at the molecular level, reflected in biochemical and physiological changes that culminate in the differentiation of embryogenic structures. During this process, the interaction between explants and the culture medium is crucial, including exposure to biomolecules secreted by plant tissues. This exchange of molecules, particularly proteins and metabolites, between intracellular and extracellular compartments may contribute to the modulation of the embryogenic response. The present study aimed to identify mechanisms involved in SE efficiency in olive through the characterisation of the proteome of high-efficiency (HE) and low-efficiency (LE) embryogenic lines and their corresponding secretome by LC–MS/MS, complemented by exometabolome analysis using ¹H NMR. The ability of secreted biomolecules to induce the embryogenic response was assessed by applying conditioned medium (CM) from HE lines to LE lines and adult material. The results revealed a higher abundance of proteins associated with vesicular transport, signalling, and cellular reorganisation in HE lines, which also exhibited, at the extracellular level, proteins related to redox regulation and cell wall dynamics, together with more efficient carbon utilisation. Application of the CM validated the role of secreted molecules in the embryogenic response by promoting increased cell proliferation and the formation of embryogenic structures in recalcitrant material. Tue, 08 Sep 2026 23:00:00 GMT http://hdl.handle.net/10174/42641 2026-09-08T23:00:00Z http://hdl.handle.net/10174/42508 Title: Performer’s Space - A interpretação musical como espaço relacional na colaboração continuada entre compositor e intérprete Authors: Silva, João Pedro Pacheco da Abstract: Esta tese investiga a interpretação musical enquanto prática relacional, analisando a colaboração continuada entre compositor e intérprete na performance musical contemporânea. Com base em dois projetos artísticos concebidos como dispositivos de investigação, o estudo procura compreender de que modo se constrói o espaço interpretativo quando essa relação se desenvolve ao longo do tempo. Em vez de abordar a interpretação como simples mediação entre partitura e realização sonora, a investigação desloca o foco para a performance enquanto espaço de decisão, escuta e negociação. A metodologia articula prática artística como investigação, questionários, entrevistas e reflexão autoetnográfica, organizadas num ecossistema metodológico orientado por uma ética da escuta e da proximidade. Os contributos recolhidos junto de especialistas, compositores, maestros, técnicos de som e editores, permitem observar a prática performativa para além de modelos normativos ou generalizáveis. Deste percurso emerge o conceito de performer’s space, entendido como um espaço interpretativo produzido relacionalmente e construído através da escuta, do tempo e da prática artística. A tese propõe, assim, uma compreensão da interpretação musical que reconhece a complexidade dos processos colaborativos e afirma a performance como lugar de produção de conhecimento artístico; - Abstract: Performer’s Space: Musical interpretation as a relational space in sustained collaboration between composer and performer This thesis investigates musical interpretation as a relational practice, examining the sustained collaboration between composer and performer in contemporary musical performance. Based on two artistic projects conceived as research devices, the study seeks to understand how interpretative space is constructed when this relationship unfolds over time. Rather than approaching interpretation as a simple mediation between score and sonic realization, the research shifts the focus towards performance as a space of decision, listening, and negotiation. The methodology articulates artistic practice as research, questionnaires, interviews, and autoethnographic reflection, organized within a methodological ecosystem guided by an ethics of listening and proximity. Contributions gathered from specialists, including composers, conductors, sound engineers, and editors, allow the observation of performative practice beyond normative or generalizable models. From this trajectory emerges the concept of performer’s space, understood as an interpretative space produced relationally and constructed through listening, time, and artistic practice. The thesis thus proposes an understanding of musical interpretation that acknowledges the complexity of collaborative processes and affirms performance as a site for the production of artistic knowledge. Tue, 28 Jul 2026 23:00:00 GMT http://hdl.handle.net/10174/42508 2026-07-28T23:00:00Z http://hdl.handle.net/10174/42506 Title: Dynamic ecological patterns of insular short-finned pilot whales Authors: Weyn, Mieke Mariette J Abstract: Effective conservation of highly mobile species, such as cetaceans, depends on understanding the spatial and temporal dynamics of habitat use, movements, and connectivity, particularly in insular systems. This thesis advances that understanding for Atlantic Naisa short-finned pilot whales inhabiting Macaronesia by integrating satellite telemetry, long-term photographic-identification data, and ecological modelling, complemented by sex-specific social analyses based on genetically sexed individuals which provide behavioral context for interpreting dispersal and philopatry. At a regional scale, marked connectivity was observed between Madeira and the western Canary Islands based on photo-identification and telemetry data. Preferred areas and movement pathways were identified, highlighting the potential importance of the western Canary Islands as a mixing area and the existence of a potential biological corridor. Specifically, in Madeira, biotelemetry and movement modelling showed that short-finned pilot whales use island-associated waters in a strongly structured way. Madeira functions as an important seasonal aggregation area, with critical near-shore habitat southeast of Madeira Island used by individuals differing in site fidelity, consistent with condition-dependent tactics in a partial-migration system. At the oceanic basin scale, crossmatching of large long-term photo-identification catalogues from the eastern and western North Atlantic found no conclusive evidence of current trans-Atlantic movements, suggesting that such interchange is either rare or difficult to detect with currently available datasets. Finally, sex-specific social analyses showed that both females and males form long-term, non-random associations, with females more strongly anchored to clusters and males contributing disproportionately to occasional inter-cluster links. Overall, this thesis shows that the dynamic ecology of short-finned pilot whales in Macaronesia is characterized by a combination of seasonal residency, recurrent inter-archipelago movements between preferred/important areas - emphasizing the need for international collaboration - and sex-specific social organization. This integrated perspective helps refine current understanding of the species and provides a stronger ecological basis for conservation planning; - RESUMO: Padrões ecológicos dinâmicos de baleias-piloto-tropicais insulares A conservação eficaz de espécies altamente móveis depende da compreensão das dinâmicas espaciais e temporais da utilização do habitat, dos movimentos e da conectividade, particularmente em sistemas insulares. Esta tese aprofunda esse conhecimento relativamente às baleias-piloto-tropicais (Globicephala macrorhynchus) na Macaronésia, integrando telemetria por satélite, foto-identificação e modelação ecológica, complementados por análises sociais específicas por sexo, baseadas em indivíduos geneticamente sexados, que fornecem contexto comportamental para interpretar dispersão e filopatria. À escala regional, os dados de foto-identificação e telemetria revelaram conectividade significativa entre a Madeira e as ilhas oeste das Canárias. Foram identificadas áreas preferenciais e corredores de movimentação, evidenciando a potencial importância destas ilhas oeste como área de mistura e a existência de um possível corredor biológico. Na Madeira, a biotelemetria e a modelação de movimentos demonstraram que as baleias-piloto-tropicais utilizam as águas associadas à ilha de forma estruturada. A Madeira funciona como uma importante área de agregação sazonal, com habitat costeiro crítico (a sudeste da ilha), utilizado por indivíduos com diferentes níveis de fidelidade, consistente com táticas dependentes da condição num sistema de migração parcial. À escala da bacia oceânica, a comparação entre catálogos de foto-identificação do Atlântico Norte oriental e ocidental não encontrou evidência conclusiva de movimentos transatlânticos atuais, sugerindo que tal intercâmbio é raro ou difícil de detetar com os dados disponíveis. Por fim, as análises sociais revelaram que tanto fêmeas como machos formam associações duradouros e não aleatórias, com as fêmeas mais fortemente associadas a grupos e os machos a contribuírem desproporcionadamente para ligações ocasionais entre grupos. No geral, esta tese demonstra que a ecologia dinâmica desta espécie é caracterizada por uma combinação de residência sazonal, movimentos recorrentes entre arquipélagos e organização social específica por sexo. Esta perspetiva integrada contribui para incrementar o conhecimento sobre esta espécie e fornece uma base ecológica mais robusta para a sua conservação. Thu, 02 Jul 2026 23:00:00 GMT http://hdl.handle.net/10174/42506 2026-07-02T23:00:00Z http://hdl.handle.net/10174/42505 Title: Espectroscopia NIR como ferramenta para predição da maturação, discriminação de variedades e monitorização da qualidade pós-colheita de uva de mesa Authors: Rodrigues, Sara Isabel Ricardo Abstract: A uva de mesa é um fruto não climatérico e perecível, cuja qualidade depende do estado de maturação à colheita e das condições de conservação pós-colheita. Os métodos convencionais de avaliação, embora rigorosos, são geralmente destrutivos e morosos, justificando o desenvolvimento de ferramentas rápidas e não destrutivas. Esta tese teve como objetivo avaliar a aplicação da espectroscopia no infravermelho próximo (NIR) na predição da maturação, discriminação varietal e monitorização da qualidade pós-colheita de uva de mesa, integrando a avaliação de soluções de embalagem sustentáveis. Foram estudadas diferentes variedades de uva de mesa e, em maior detalhe, a variedade Crimson Seedless. Determinaram-se parâmetros físico-químicos, texturais e bioativos, e os espectros NIR foram analisados por PCA, PLSR e PLSDA. Os resultados demonstraram que a espectroscopia NIR apresentou elevado potencial para a avaliação da maturação, sobretudo na predição dos sólidos solúveis totais, com melhor desempenho nos modelos específicos para ‘Crimson Seedless’ do que na abordagem global multivarietal. A caracterização de variedades com diferente pigmentação da película evidenciou diferenças físico-químicas e bioativas, tendo os modelos NIR permitido discriminar grupos de coloração dentro do domínio varietal utilizado na calibração. Na conservação pós-colheita, o tempo de armazenamento foi o fator com efeito mais consistente na qualidade, enquanto as modalidades de acondicionamento apresentaram efeitos menos significativos. Globalmente, a espectroscopia NIR revelou-se promissora para apoiar a monitorização rápida e não destrutiva da qualidade da uva de mesa, embora a sua aplicação prática exija modelos mais robustos, representativos e validados em diferentes condições; NIR Spectroscopy as a tool for maturity prediction, variety discrimination, and postharvest quality monitoring in table grapes - Abstract: Table grape is a non-climacteric and perishable fruit whose quality depends on the ripening stage at harvest and on postharvest storage conditions. Conventional quality assessment methods, although accurate, are generally destructive and time-consuming, supporting the need for rapid and non-destructive tools. This thesis aimed to evaluate the application of near-infrared (NIR) spectroscopy for maturity prediction, varietal discrimination and postharvest quality monitoring of table grapes, integrating the assessment of sustainable packaging solutions. Different table grape varieties were studied, with particular focus on ‘Crimson Seedless’. Physicochemical, textural and bioactive parameters were determined, and NIR spectra were analysed using PCA, PLSR and PLS-DA. The results demonstrated that NIR spectroscopy showed high potential for maturity assessment, particularly for the prediction of total soluble solids, with better performance in variety-specific models for ‘Crimson Seedless’ than in the global multi-varietal approach. The characterisation of varieties with different skin pigmentation revealed physicochemical and bioactive differences, and the NIR models allowed the discrimination of skin colour groups within the varietal domain used for calibration. During postharvest storage, storage time was the factor with the most consistent effect on quality, whereas the packaging treatments showed less uniform effects. Overall, NIR spectroscopy proved to be a promising tool to support rapid and non-destructive monitoring of table grape quality, although its practical application requires more robust and representative models, validated under different conditions. Thu, 30 Jul 2026 23:00:00 GMT http://hdl.handle.net/10174/42505 2026-07-30T23:00:00Z