DSpace Collection:http://hdl.handle.net/10174/2902024-03-29T15:49:51Z2024-03-29T15:49:51ZEstudo teórico da estrutura e dinâmica de péptidos inibidores da fusão do HIV em água e membranas biológicasMartins do Canto, António Manuel teixeirahttp://hdl.handle.net/10174/100122014-01-24T16:35:08Z2013-06-16T23:00:00ZTitle: Estudo teórico da estrutura e dinâmica de péptidos inibidores da fusão do HIV em água e membranas biológicas
Authors: Martins do Canto, António Manuel teixeira
Abstract: A acção dos péptidos inibidores de fusão (FI) do HIV, T-20 e T-1249, foi analisada nesta tese
por uma abordagem in silico através da técnica de dinâmica molecular (MD). Foi estudada tanto a
estrutura como a dinâmica destes FI em três situações diferentes: em solução (com o intuito de
tentar mimetizar a situação do péptido no plasma sanguíneo) e a interagir com modelos de
membranas de 1-palmitoil-2-oleil-fosfatidilcolina (POPC) (na fase líquido desordenado - Ld) e
membranas de POPC / colesterol (1:1) (POPC / Chol) (na fase líquido ordenado – Lo). Com isto
tentámos perceber se haveria diferenças na capacidade de ambos os FI em interagir com
membranas em duas fases distintas com o intuito de correlacionar esses resultados quer com a
eficiência aumentada do T-1249 quer com o modelo de acção proposto por Veiga e colaboradores
[Veiga et al, 2004a; Veiga et al, 2004b]. Este modelo propunha que um dos factores para a maior
eficiência do T-1249 seria a sua maior capacidade de adsorver a membranas, nomeadamente na
fase Lo, o que teria como consequência uma maior concentração local destes FI e, como tal, uma
maior disponibilidade para interagir com as glicoproteínas responsáveis pelo processo de
reconhecimento e fusão das membranas do vírus e da célula alvo. Os nossos resultados
comprovaram esta suposição: uma maior capacidade da parte do T-1249 de interagir com
membranas nas duas fases nomeadamente via pontes de H. O péptido T-1249 faz mais pontes de
H com as membranas e estabelece-as via diversos resíduos de aminoácidos que se estendem ao
longo de todo o péptido, ao contrário do que se passa com o T-20 que forma menos pontes de H e
em que os resíduos envolvidos no processo estão mais restringidos à região junto do C-terminal.
Estes péptidos são portadores de um domínio designado por TRD (tryptophan rich domain) no Cterminal
com capacidade de interagir com membranas, mas apenas o T-1249 possui um domínio
anfipático adicional, designado PBD (pocket binding domain), que também possui esta capacidade.
Os nossos resultados mostram não só a importância deste segundo domínio na interacção com as
membranas, como apontam para a importância da presença dos dois domínios no desenho de
péptidos FI para uma eficiência aumentada na inibição da fusão das membranas.2013-06-16T23:00:00ZEstudos de Síntese e Caracterização de Óxidos Mistos do Tipo EspinelaFerreira, Teresahttp://hdl.handle.net/10174/90622013-12-12T17:17:06Z2007-06-18T23:00:00ZTitle: Estudos de Síntese e Caracterização de Óxidos Mistos do Tipo Espinela
Authors: Ferreira, Teresa
Abstract: A detailed study of the preparation and the characterization of polycrystalline FeCo2O4 and CoFe2O4 samples with the spinel structure, belonging to the Co1+xFe2-xO4 (x = 0; 1)system has been undertaken, in order to evaluate the ionic competition by site occupation and the relation between structure and properties, regarding to their potential use as electrode materials.
Three distinct preparation methods were tested – the direct ceramic method, a wet
chemistry route and a sol-gel type process – with different parameters: starting materials, stages in characterization corresponding to distinct annealing treatments and cooling process – quenched (q) and slowly cooled samples at 3 K min-1 (sc). After the optimization of these conditions, stoichiometric single-phase samples with spinel structure were obtained.
All compounds were characterized by powder X-ray diffraction and scanning electron
microscopy combined with X-ray microanalysis, energy dispersive spectroscopy for structural and morphological information. The total Fe and Co contents were estimated by inductively coupled plasma emission spectroscopy and atomic absorption spectroscopy respectively. Associated with the EDS results, these techniques supplied a useful tool for
the evaluation of the chemical homogeneity and stoichiometry of the samples.
Crystal data and site occupation factors were estimated from phase analysis and structure refinement by Rietveld analysis of powder diffractograms. The non-linear enthalpy of disordering model of O’Neill and Navrotsky was applied to FeCo2O4 and CoFe2O4 spinel phases and the degree of inversion, λ, could be successfully estimated, and afterwards it was compared with the one derived from the experimental techniques.
The wet chemistry route has provided excellent reproducibility and a straightforward and rapid way for powder preparation. Moreover, the samples have shown good stability and chemical and morphological homogeneity. For this reason, these samples were chosen to be the subject of a more fundamental characterization and evaluation of their properties. 57Fe Mössbauer spectroscopy revealed that iron was present as Fe3+ and it allowed an
estimation of the relative fractions of Fe3+ in tetrahedral and octahedral sites, which
combined with powder XRD, providing a more accurate cation distribution. The surface of
the materials was analysed by X-ray photoelectron spectroscopy, which showed cobalt segregation in samples prepared at low temperature for both FeCo2O4 and CoFe2O4
stoichiometries. The powders obtained at 1173 K presented that the overall Co/Fe ratios were in accordance with the theoretical values. The fast atom bombardment technique revealed that Fe+ ion was the preferential species being ejected (sputtered) from the sample, suggesting that Fe-O binding energy was smaller than the Co-O. The result was in agreement with the infrared spectra analyses, which showed a deviation of the absorption bands to lower frequency values when Co3+ ions were replaced by Fe3+ ions, with an increase of the Fe3+ fraction in tetrahedral coordination. Nitrogen adsorption studies at 77 K were carried out and revealed high specific surface areas in the samples prepared at 573 K (>100 m2 g-1). Thermogravimetric analysis supplied information about the samples behaviour in the 293 – 1273 K range and the possibility of Co2+ oxidation at ≈560K. Electronic properties were analysed by electric conductivity studies that pointed out a
hopping semiconductor behaviour of carriers between localized states, and magnetization
studies with temperature and applied field and hysteresis curves, showing a strong
dependence of composition, cation distribution and morphology. The samples presented a ferrimagnetic order and the Néel collinear model successfully described the cation arrangement.
As a conclusion, it was possible to synthesize the CoFe2O4 and FeCo2O4 samples using the defined preparing conditions. Furthermore, their characterization with the available techniques showed that these materials present potential interest for application, namely, as electrode materials.2007-06-18T23:00:00ZRegulação da actividade da Na,K-ATPase por glucose em célula beta-pancreática na ausência e na presença de um estado de intolerância a estaCosta, Anahttp://hdl.handle.net/10174/57712012-11-20T11:16:23Z2012-06-03T23:00:00ZTitle: Regulação da actividade da Na,K-ATPase por glucose em célula beta-pancreática na ausência e na presença de um estado de intolerância a esta
Authors: Costa, Ana
Abstract: A Na,K-ATPase é responsável pela manutenção dos gradientes transmembranares de iões K+ e Na+. Porém, o papel fisiológico da Na,K-ATPase em célula β-pancreática não está esclarecido. Já foi sugerido que a glucose contribui para uma regulação da Na,K-ATPase nestas células, embora os efeitos não estejam esclarecidos e se desconheçam os mecanismos subjacentes ou a sua relevância fisiológica.
Foi objectivo deste trabalho estudar a acção da glucose na regulação da actividade enzimática da Na,K-ATPase em célula β-pancreática, na presença e ausência de intolerância à glucose.
Concluiu-se que, em controlos, a glucose induziu uma inibição da actividade da Na,K-ATPase e que a AMPK e a PKC parecem participar na cascata de sinais intracelulares subjacente a esta regulação. Em intolerantes registou-se uma atenuação/abolição do efeito da glucose na actividade da Na,K-ATPase. Para estas diferenças contribuíram a expressão isoenzimática diferencial da Na,K-ATPase e alterações na cascata de eventos responsáveis pela regulação.2012-06-03T23:00:00ZEspecificação e Prototipação de Sistemas de Gestão e Controlo da Qualidade da Água de AlbufeirasVicente, Henriquehttp://hdl.handle.net/10174/48652012-02-29T10:46:55Z2004-01-01T00:00:00ZTitle: Especificação e Prototipação de Sistemas de Gestão e Controlo da Qualidade da Água de Albufeiras
Authors: Vicente, Henrique
Abstract: É possível re-equacionar os problemas subjacentes à temática da modelação da qualidade da água em albufeiras através de metodologias de resolução de problemas que emanam da Área Científica da Inteligência Artificial, assim como de ferramentas usadas na procura de soluções como as Árvores de Decisão, a Indução de Regras, as Redes Neuronais Artificiais e o Raciocínio Simbólico.
O presente trabalho descreve modelos para a previsão da qualidade da água em albufeiras. Um destes modelos fundamenta-se em técnicas de Descoberta de Conhecimento em Bases de Dados, enquanto o outro se baseia no Raciocínio Simbólico. Os sistemas sub-simbólicos apresentam-se como complementares dos sistemas simbólicos permitindo, a partir destes, elaborar sobre sistemas de previsão e/ou simulação do estado futuro da qualidade das águas em albufeiras.
Verificou-se que as fontes de informação na área do ambiente, particularmente no que concerne à qualidade da água em albufeiras, são variadas, heterogéneas e complexas, encontrando-se dispersas por diversas entidades, organismos e instituições. Esta dispersão não só torna difícil definir e caracterizar os problemas como impede a tomada das melhores decisões para os solucionar em tempo útil. Uma solução para este tipo de senãos passa pela integração, difusão e armazenamento desta informação diversificada num corpo único de forma a permitir a partilha de conhecimento com quem efectivamente dele necessita.
Neste trabalho é apresentada uma Agência para a Integração, Difusão e Arquivo de Informação sobre a QUalidade da Água de Albufeiras – AQUA. A agência AQUA disponibiliza trabalhadores electrónicos inteligentes para tratar uma multitude de tarefas, tais como a comunicação entre os diferentes sub-sistemas, o enviar e receber informação (e.g. resultados das análises laboratoriais, resultados fornecidos pelos sistemas de aquisição automática de dados, informação relevante sobre as bacias, tais como cartas, levantamentos topográficos, modelos digitais do terreno, fontes de poluição pontual, utilização do solo, dados meteorológicos e climáticos, caracterização geomorfológica), o gerir, guardar e responder a pedidos de informação. A agência AQUA é, na sua essência, uma Data Warehousing associada a Sistemas MultiAgente. O objectivo principal passa por integrar, difundir, e arquivar grandes volumes de informação das mais diversas proveniências de forma a facilitar o rápido acesso à informação. A agência AQUA constitui um exemplo de aplicação de técnicas inovadoras da Área Científica da Inteligência Artificial a domínios do interesse público, neste caso à gestão e controlo dos recursos hídricos.2004-01-01T00:00:00Z